2006年2月25日，广州医药足球俱乐部正式成立。

　　俱乐部由广州白云山制药股份有限公司、广州中一药业有限公司、广州白云山和记黄埔中药有限公司、广州星群药业股份有限公司、广州王老吉药业股份有限公司、广州潘高寿药业股份有限公司、广州白云山侨光制药有限公司、广州奇星药业有限公司、广州白云山光华制药有限公司、广州陈李济药厂、广州白云山明兴制药有限公司、广州白云山何济公制药有限公司、广州敬修堂药业股份有限公司、广州白云山天心制药有限公司共同投资组建。

　　广州足球队历史上是一支不容忽视的劲旅，曾经为国家队输送过赵达裕、吴群立、麦超、彭伟国、孔国贤等优秀球员。

　　2007年，广州医药队以中甲冠军的身份升入中超联赛。