中新社北京十二月十二日电(记者孙自法)中国科学院今天在此间举行新闻发布会宣布,继去年率先完成水稻(籼稻)基因组工作框架图之后,中国科学家又在此基础上率先独立完成了该基因组的“精细图”。
这一“精细图”据称是全世界第一张农作物的基因组精细图谱,也是迄今为止唯一的基于“全基因组鸟枪法”构建的大型植物基因组高精度基因图。其覆盖了百分之九十七的基因序列,其中百分之九十七的基因被精确定位在染色体上,覆盖基因组百分之九十四染色体定位序列的单碱基准确性达到了百分之九十九点九九,“精细图”和构成它的DNA序列均已达到国际公认的基因精细图标准。
“精细图”测序工作主要由中科院基因组信息学中心承担,该中心科学家杨焕明、于军也因在水稻基因组研究领域的贡献,同时荣获《科学美国人》杂志今年首度评选的“年度科研领袖”。
于军在发布会上介绍说,“精细图”绘制了水稻亚种内和亚种间分子遗传标记图谱,通过对籼稻和粳稻亚种基因组已定序列的比较分析,发现了一百多万个单核苷酸多态性位点。这些标记可以用来鉴别基因的起源和进化,追踪它们在遗传群体中和杂交过程中的分布,进而指导遗传育种实践。
“精细图”还预测出约六万个水稻基因,利用这些信息制备出全基因组基因芯片,将为功能基因组研究提供强有力的工具,为大规模分离抗病、高产、优质的相关基因奠定基础。
中国水稻基因组研究成本很低,投入产出比达一比七。中国自主研制的“曙光3000”和“神威”大型计算机在基因组的海量数据处理方面,为完成“精细图”作出了积极贡献。
此间专家认为,“精细图”确定了基因在染色体上的分布和定位,以及以基因多态性为基础的可用于分子育种的遗传标记,为阐明水稻基本生物学性状的遗传基础,识别、筛选具有经济价值的遗传基因打下了坚实基础。“它的巨大科学意义和潜在应用价值,将在未来科学研究及生产实践中逐渐显示出来。”
二00一年十月,中国率先完成水稻(籼稻)基因组工作框架图的绘制,并向全球免费公布数据库;今年四月,权威的《科学》杂志以十四页的篇幅发表中国科学家这一成果,称其为“具有最重要意义的里程碑性工作”。