组合体飞行期间，3名航天员在轨正常工作和生活，开展了一系列空间科学实验和技术试验。 6月28日9时24分，航天员刘旺手动控制神舟九号飞船与天宫一号目标飞行器再次分离，并撤离至140米停泊点，飞船转自主控制，继续撤离至5公里外安全距离，并开展了重入自主控制至140米停泊点的交会飞行试验。今天9时17分，飞船进入返回程序，于10时03分准确降落在预定区域。天宫一号目标飞行器已经抬高运行轨道，最终将进入高度约370千米的长期运行轨道。
此次任务的圆满成功，归功于党中央、国务院、中央军委的正确领导，归功于全国人民的大力支持，归功于全体参研参试人员的奋力拼搏。在欢庆胜利的同时，我们也清醒地认识到，我国载人航天技术与国际先进水平相比，还有相当的差距，我们的工作与国家和民众的期盼，也有一定的距离。要全面完成我国载人航天工程“三步走”的战略目标，后续任务依然十分艰巨，任重而道远，我们一定不懈努力，继续攀登。
