MK99火控分系统，负责按照武器控制分系统的指令，与AN/SPY-1A雷达一起工作，用AN/SPG-62雷达照射目标，对已发射的导弹提供末段制导。这是2008年1月26日，美国阿利·伯克级驱逐舰“莫森号”在太平洋进行反潜训练。