1988年3月10日，海军召开JL-2武器系统战术技术指标、使用要求及技术攻关论证会，3月30日向国防科工委上报，国防科工委于6月8日批准。由于技术难度较大，JL-2迟迟没有立项。不过海军试验基地还是进行了模型弹水下弹射试验。
第二代固体战略核导弹基本型DF-31于1999年8月2日首飞成功，同年底DF-31A和JL-2立项。JL-2由中国运载火箭技术研究院设计，包为民任总设计师，李明华任总指挥。固体火箭发动机由航天科技集团四院设计制造，侯晓任总设计师。与基本型相比，为了大幅度提高射程，JL-2采用了高能固体推进剂NEPE，芳纶纤维复合材料壳体、碳/碳复合材料可抛式延伸喷管。我国是继美、法之后第三个掌握NEPE推进剂技术的国家，走在了俄罗斯的前面。
1988年3月，七院召开094型号预研工作会议。5月3日，国防科工委确定094艇为八五期间综合论证项目。
1994年，新一代核潜艇研制工作正式启动。1996年，094工程立项，719所前所长张金麟任总设计师，艇用核反应堆由中国核动力研究设计院设计。1999年底，094首艇开工，2004年7月下水，随后开始航行试验。094艇长约133米，水下排水量约9000吨。
