反舰弹道导弹在发射时装填由远程侦察系统（卫星、无人机）提供的目标数据。如果在战时可部署超过２０枚侦察卫星，就可做到每半小时更新一次目标数据，并由天波雷达进行实时跟踪，这样对目标定位的最大误差不会超过２２千米（＂尼米兹＂级航母３５节航速下２０分钟航程），这足以满足导弹发射的需要。
导弹进入距离目标２００－３５０千米的高空制导段时，目标最大可偏离初始定位位置１１千米（＂尼米兹＂级航母３５节航速下１０分钟航程），系统误差达到１５－３８千米，如果不加修正目标可能脱离导弹低空机动范围。对此导弹可以由下一颗经过目标区的卫星提供目标坐标，也可通过被动雷达或者多模态微波观测仪自行探测，假如雷达的测向精度达到１°，定位误差就是３．５千米，远远小于弹头的末端机动范围。
在距离目标６０千米的低空制导段，弹头速度降低到６马赫以下，可使用主／被动雷达、红外制导头搜索目标，这时弹头高度约２０千米，有约２０°－４０°的俯视角，虽然会受到海面杂波的强烈干扰，但航母不是飞机、导弹等低空小目标，它的雷达反射截面积高达十万平米，其雷达特征与海面杂波差别巨大，普通的频率捷变的单脉冲体制的主动雷达也可以发现目标，如美国＂鱼叉＂导弹在末端跃起攻击时就有２０°的俯视角。
